Man bør bestemt ikke snyde sig selv for et besøg i det fantastiske og unikke økosystem, Amazonjunglen, som Peru er en del af. Amazonjunglen, med navn efter verdens største flod, er kendt som verdens lunger. Den del der ligger i Peru anses for at være noget af det mest uspolerede. Her finder man en unik biodiversitet med over 70 % af verdens levende arter.
Stik øst for Cuzco finder man området Puerto Maldonado og direkte mod nord ved bredden af Amazonfloden, Iquitos.